Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AP3B2Q13367 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms