Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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