Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)22.01■■□□□ 1.112e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 521.9■■□□□ 1.12e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)21.79■■□□□ 1.082e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.913e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GFI1B-201ENST00000339463 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 13.4
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PABPC4Q13310 ATP13A1-207ENST00000473243 4729 ntTSL 216.33■□□□□ 0.21e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 ATP13A1-214ENST00000497556 2442 ntTSL 214.75□□□□□ -0.051e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 ATP13A1-205ENST00000469641 4241 ntTSL 211.53□□□□□ -0.561e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 ECI1-205ENST00000563447 965 ntTSL 219.42■□□□□ 0.78e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.861e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.741e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.529e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.089e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TONSL-202ENST00000497613 6607 ntTSL 216.96■□□□□ 0.312e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.072e-7■■□□□ 13.4
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PABPC4Q13310 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 311.46□□□□□ -0.575e-8■■□□□ 13.4
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PABPC4Q13310 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.865e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 56.69□□□□□ -1.345e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.675e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.775e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MRPL33-203ENST00000448427 527 ntTSL 412.28□□□□□ -0.444e-8■■□□□ 13.4
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PABPC4Q13310 MRPL33-205ENST00000476552 587 ntTSL 27.59□□□□□ -1.194e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 14e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-16■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.722e-12■■□□□ 13.4
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PABPC4Q13310 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)10.5□□□□□ -0.732e-12■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-12■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-27■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TCF3-216ENST00000592395 996 ntTSL 522.15■■□□□ 1.147e-7■■□□□ 13.4
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PABPC4Q13310 TCF3-217ENST00000592628 1751 ntTSL 517.77■□□□□ 0.447e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 216.93■□□□□ 0.37e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.027e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.077e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.097e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.423e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.053e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 AC120114.5-201ENST00000562285 556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.223e-9■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 DESI1-201ENST00000263256 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 57.45□□□□□ -1.227e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 THOC2-217ENST00000492203 641 ntTSL 36.77□□□□□ -1.337e-8■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 54.62□□□□□ -1.677e-8■■□□□ 13.4
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PABPC4Q13310 RPL23-203ENST00000394332 625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.13e-85■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 RPL23-204ENST00000394333 444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.213e-85■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 RPL23-206ENST00000479035 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.563e-85■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 RPL23-211ENST00000584912 2779 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.813e-85■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NACA-205ENST00000546410 600 ntTSL 25.63□□□□□ -1.517e-30■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.915e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.265e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 AC097637.1-202ENST00000478201 570 ntTSL 213.31□□□□□ -0.285e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 AC097637.1-201ENST00000494383 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.455e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 CHCHD10-205ENST00000523865 490 ntTSL 210.23□□□□□ -0.772e-36■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 DGUOK-205ENST00000462685 715 ntTSL 316.89■□□□□ 0.296e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 DGUOK-204ENST00000462551 573 ntTSL 212.99□□□□□ -0.336e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 DGUOK-206ENST00000489796 692 ntTSL 312.89□□□□□ -0.356e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 DGUOK-207ENST00000493055 593 ntTSL 26.39□□□□□ -1.396e-6■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NAP1L1-223ENST00000552013 679 ntTSL 28.54□□□□□ -1.043e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 56□□□□□ -1.453e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 IMPDH2-205ENST00000463903 420 ntTSL 213.92□□□□□ -0.182e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.192e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-222ENST00000497304 932 ntTSL 1 (best)22.45■■□□□ 1.182e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.012e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-243ENST00000532772 1618 ntTSL 518.52■□□□□ 0.562e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.492e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.412e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-210ENST00000458452 2571 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.272e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-216ENST00000478641 3079 ntTSL 216.5■□□□□ 0.232e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-214ENST00000470030 2369 ntTSL 515.98■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 INTS11-212ENST00000462432 2863 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.352e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.478e-10■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.518e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.518e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NUDT22-206ENST00000535000 1071 ntTSL 224.46■■□□□ 1.518e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NUDT22-210ENST00000543358 659 ntTSL 324.14■■□□□ 1.458e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NUDT22-211ENST00000543501 475 ntTSL 217.54■□□□□ 0.48e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NUDT22-212ENST00000545184 581 ntTSL 414.47□□□□□ -0.098e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 NUDT22-207ENST00000537094 475 ntTSL 211.97□□□□□ -0.498e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 CAD-203ENST00000428460 953 ntTSL 515.31■□□□□ 0.044e-7■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-28■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.043e-28■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 CLTC-209ENST00000498711 2941 ntTSL 1 (best)4.29□□□□□ -1.723e-28■■□□□ 13.4
PABPC4Q13310 MRPS22-202ENST00000465056 1099 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-7■■□□□ 13.4
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