Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX3Q13185 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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