Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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