Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MKRN3Q13064 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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