Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM32Q13049 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms