Protein–RNA interactions for Protein: Q12982

BNIP2, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP2Q12982 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP2Q12982 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms