Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN2AQ12879 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
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