Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLFN5Q08AF3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms