Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PUDPQ08623 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms