Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms