Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms