Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP1-1Q07627 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms