Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms