Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms