Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALD1Q05682 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms