Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms