Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMX2Q04743 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMX2Q04743 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms