Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC011477.4-201ENST00000590274 609 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC109597.1-201ENST00000564016 786 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms