Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CENPEQ02224 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CENPEQ02224 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms