Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK16Q00536 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms