Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms