Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK-24P63145 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-24P63145 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms