Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTA2P62736 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA2P62736 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ACTA2P62736 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA2P62736 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA2P62736 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA2P62736 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA2P62736 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA2P62736 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA2P62736 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA2P62736 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTA2P62736 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms