Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms