Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SUMO3P55854 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUMO3P55854 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms