Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLTPP55058 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLTPP55058 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms