Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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