Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP4P49662 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP4P49662 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms