Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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