Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms