Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD2P49005 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD2P49005 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD2P49005 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD2P49005 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms