Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NESP48681 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NESP48681 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NESP48681 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NESP48681 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms