Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT6CP48668 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms