Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms