Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACADSBP45954 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms