Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR1P43307 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR1P43307 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms