Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms