Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP2P42575 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms