Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms