Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFNP31947 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFNP31947 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFNP31947 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms