Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA5P31644 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA5P31644 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA5P31644 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms