Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms