Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms