Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2AP28223 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms