Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms