Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APCP25054 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APCP25054 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APCP25054 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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