Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms