Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRHP20396 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRHP20396 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRHP20396 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRHP20396 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRHP20396 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRHP20396 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRHP20396 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRHP20396 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRHP20396 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRHP20396 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRHP20396 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRHP20396 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRHP20396 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms